随着北大方正和政泉控股的持续缠斗，有关双方的背景事件不断被挖出。有媒体报道指，2003年方正改制期间，怀疑国有资产流失高达19亿（人民币，1美元约合6.2元人民币，下同），而方正高管控制的几百万规模小公司，则以极低价格，“四两拨千斤”控股有数十亿净资产的方正集团。此外，媒体1月13日披露，近日国安部副部长马健因涉嫌贪腐被带走调查，也被认为与方正集团管理层被带走有关。
北大方正原CEO李友
此前有媒体报道指，2014年11月初至今，方正旗下上市公司市值合计蒸发了57亿人民币。同期，一度与方正携手合作的亲密战友政泉控股，也不断指控方正多名高管腐败，包括前CEO李友等人，涉嫌内幕交易炒卖方正旗下的北大医药股票，导致国有资产流失。
2015年1月4日，方正集团宣布，董事长魏新、CEO李友、总裁余丽应相关部门要求协助调查。1月5日晚，北大医药宣布，方正集团副总裁李国军应相关部门要求协助调查。
而据《南华早报》1月13日报道，有消息人士向表示，国安部副部长马健因涉嫌贪腐被带走调查。一般认为，事件与方正集团管理层被带走协助调查有关。
政泉控股在举报信中称，李友等人，在主导方正集团2003年股权改制过程中，为实现侵吞国有资产的目的，操控方正集团内部及外部各相关单位和个人，将方正集团的国有资产价值低估，使方正集团的净资产，从2002年末的20亿，缩水到1.5亿，并以此明显过低的股价，与由他们自己完全持股的北京招润投资管理有限公司为交易对手，使北京招润以极低成本价获得了方正30%的股权。
早在2011年，就曾有媒体就方正改制提出质疑，更指其是“侵占国有资产”的“灰色私有化”。
该报道指，工商资料显示，2003年12月，中保资产评估有限公司出具了方正集团的资产评估报告，以2003年3月31日为评估基准日，结果显示，集团净资产为1.5亿元。2002年底，方正集团净资产为20亿元。
北大资产2005年第7期《中国高校科技与产业化》杂志上《北京大学：深化改革迎接新挑战》署名文章介绍了方正2003年改制的情况。
文章指，经评估，方正的净资产为1.49亿元，北大通过北大资产持股35%，以1.49亿元净资产评估价值为基础，由北大向三家战略投资者溢价转让65%的权益，并签署响应协议。
其中，向两家外部战略投资者----深圳市康隆科技发展有限公司、成都市华鼎文化发展有限公司，分别转让17%、18%的权益，向由方正集团管理层和员工组成的内部战略投资者----北京招润转让30%的权益。
作价方法是，向深圳康隆和成都华鼎，以6倍溢价转让35%的权益，作价3.15亿；向北京招润以不低于净资产价格转让30%的权益，作价仅4,480万。
同时，方正旗下上市公司公告显示，截至2002年末，方正集团净资产为20亿元左右，而不是上述文章说的1.49亿元。
全国企业信用信息公示系统显示，北京招润2001年6月成立，注册资本金1,000万，多位“方正系”高管位列自然人股东，其中李友出资329.8万，余丽出资233.2万，魏新出资47.8万……
2005年末，北京招润总资产只有1.7亿，净资产为负390万，到2009年末，总资产6,295万，净资产250余万，负债率高达96%。
净资产250万的北京招润，却能拥有净资产60多亿的方正集团。
《中国经济周刊》报道指，深圳康隆和成都华鼎，据称也与方正高管有或明或暗的关系。
2014年底，政泉控股相关人士在受访时曾表示，深圳康隆一些股东，与方正集团一些高管亲属，有一系列姓名巧合。
比如，深圳康隆的宋玉华、姚晓峰，与余丽的母亲和丈夫名字相同。深圳康隆的陈永畅，与方正科技前财务总监、副总裁李某某的丈夫同名。
成都华鼎的4名自然人股东中，有余丽、方某某和冯某某，与方正前任或现任高管同名。
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