国史馆将从8月1日起根据《政府资讯公开法》规定，拒绝陆港澳3地学者调阅馆藏资料，引发两岸学者哗然；国史馆馆长吴密察表示，这是国家档案最高主管机关档案局的规定，只是国史馆过去“违法”未遵从，现在只是让档案主管机关规范齐一，避免紊乱，“这跟任何政治因素都无关，国史馆是依规定来做的。”
据台湾《联合晚报》7月29日报道，吴密察说，为了让国史馆与档案局同步，他拜访过档案局两次，对方说，他们也曾去函法务部申请函释，函释后确实就是说，非“中华民国国民”不可申请借阅资料；至于外国人则依据平等互惠原则开放，而中国大陆地区一直没有对我方开放资料查阅，因此国史馆作法只是依法行政。
国史馆大量收藏1949年之前政府相关档案，一直是两岸研究近代中国史学者重要的学术资源，但传吴密察上任后，修改相关借阅规定，拒绝陆港澳学者调阅馆藏，并将台湾学者申请预约时间拉长为15天，一改过去到馆“随借随看”模式，引发学界质疑。
吴密察解释，改变规范的考量很单纯，就是根据《政府资讯公开法》的规定，以及档案局借阅资料的规范来调整国史馆规范；他指出，国史馆过去一直没有落实《政府资讯公开法》相关规范，让主管档案的各个单位规范不一，这是不对的，“总不能一国两制”，因此他是朝向所有档案机关一致的方向去调整，“法律已经有明文规定，国史馆不能违法行事。”
为何将台湾学者申请借阅档案的时间拉长至15天？吴密察表示，这同样是根据档案局行之有年的规范照做，由于事涉机密、个人资料的档案，需要主管机关逐件审查、准驳，因此需要有作业时间，档案局规范是15天，因此国史馆也跟从其规定。他
也说，目前国史馆初步是规范15天，但若施行后，国史馆人力可配合，也会考虑将准驳规定缩短，毕竟方便学者借阅资料，当然也希望作业时间能缩短，愈快愈好。
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