2月1日晚间，阿里巴巴与蚂蚁金服联合宣布，根据2014年双方签署的战略协议，并经阿里巴巴董事会批准，阿里巴巴将通过一家中国子公司入股并获得蚂蚁金服33%的股权。
2014年8月，阿里巴巴发布的招股书中公开披露了这一潜在的交易安排。根据当时的协议，蚂蚁金服每年需向阿里巴巴支付知识产权及技术服务费，金额相当于蚂蚁金服税前利润的37.5%；同时，在条件允许的情况下，阿里巴巴有权入股并持有蚂蚁金服33%的股权，并将相应的知识产权转让给蚂蚁金服，上述分润安排同步终止。
2011年，支付宝修改VIE协议曾引发争议，对此，支付宝和阿里股东签有补偿协议，约定支付宝以知识产权许可费与技术服务费名义每年向阿里支付税前净利49%，直至蚂蚁金服IPO。阿里巴巴2014年IPO前与蚂蚁金服修订支付宝框架协议，包括对蚂蚁金服税前利润分享从49.99%降至37.5%，分享总池子则从支付宝扩大到蚂蚁金服。
对于此次阿里入股蚂蚁金服，阿里巴巴CEO张勇表示：“阿里巴巴以让天下没有难做的生意为使命，这次入股是我们与蚂蚁金服长期战略合作的又一重要里程碑。持有蚂蚁金服股权，阿里巴巴将可以与中国第一大移动支付和TechFin平台进行更加紧密的协同，从而促进用户规模的增长和用户体验的提升，也能更好地分享全球金融科技行业的成长机会。”
蚂蚁金服CEO井贤栋表示，阿里巴巴是一家由中国人创办及实际控制的中国公司，蚂蚁金服与阿里巴巴在使命和文化上一脉相承。基于更紧密的股权关系，双方将在服务小微企业和实体经济、探索农村电商和普惠金融，以及围绕eWTP探索中国企业全球化方面更紧密的协同。“这将帮助我们更好地把蚂蚁金服打造成一家中国的国民企业。”
蚂蚁金服的前世今生
据媒体公开报道，2011年之前，支付宝接近70%的股权被美国雅虎和日本软银公司控制。而国家不允许外资企业进入第三方支付领域，对外资企业从事第三方支付服务进行限制。马云为了让支付宝顺利获得支付牌照，在未经软银和雅虎同意的情况下把支付宝的股权转移到自己名下的纯内资公司，从而实现了国内企业100%控股。
起初，雅虎与软银希望以VIE的方式绕过监管获取牌照，即注册内资公司获得牌照，再通过协议安排将内资公司的收益和管理都交予三方的合资公司。
而马云认为VIE模式获取牌照是违规的，他表示，“央行反复要求我们保证不存在外资成分和协议控制情况，我们必须遵守法律”，因此在董事会未达成一致的情况下将支付宝股权转出。
2011年5月，阿里巴巴集团将支付宝的所有权转让给马云控股的一家中国内资公司——浙江阿里巴巴，以帮助支付宝获得在中国境内的第三方支付牌照。阿里巴巴集团、雅虎和软银当时就支付宝股权转让事件正式签署协议，支付宝将向阿里巴巴集团支付巨额补偿，在支付宝未来上市时向阿里巴巴集团支付一次性现金回报。
2014年6月，浙江阿里巴巴改名为“浙江蚂蚁小微金融服务集团”，这便是今日的蚂蚁金服。
蚂蚁金服股权结构图（由全天候科技作者根据天眼查信息整理）
对于支付宝放弃VIE事件，有外界声音质疑马云“违背契约精神”，马云也坦诚：“不完美，但唯一正确”。他所说的“不完美”指的是单方面取消VIE有违约之嫌；他所说的“唯一正确”指的是100%遵守了国家法律。
2016年12月，蚂蚁金服从有限责任公司变更为股份制公司，全称为“浙江蚂蚁小微金融服务集团股份有限公司”。
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