我本人是生物专业和基础医药学专业一直读到博士，在博士后才转的生物信息，跌跌撞撞，用了好几年 才算是马马虎虎成功。这一路下来经验不多，教训不少，所以想把教训和体会都写下来供后来者师弟师妹参考。这里的生物可能包括的范围广一点，不单是综合大学师范大学的生物生化生物技术专业，也包括医学，农科，畜牧兽医，环境等等。
生物信息这么学科要求的基础特别广（不一定多深，当然深也是好的）。 计算机科学，统计学，生物医学都要懂，而且最好都要达到硕士以上的水平，其中生物是最能快速入门的，而编程和统计学可没那么好入门，所以造成这个学科的一个现象是做出突出成就的往往不是生物专业，而是数理和计算机的。中国乃至世界的生物学科教学最大的缺陷是数理基础太差，比如大多数学校的线性代数讲的很浅或者不讲，在中国只有中科大数理基础还算过关。生物人的编程一般也较差，但是编程半年时间还能赶上来很多，或者说对很多工作必须的编程基础也勉强够用，但数学基础补齐来就比较麻烦。对生物人来说，如果是读生物信息的研究生的话最好读到博士，因为这么广阔的背景要求，如果只是读一个硕士，往往还是稀里糊涂的，没学明白就毕业了。读博士的话，这样你有前三年的时间按照计算机系和统计学的要求学好各专业核心课程，打好基础，后面2-3年做一到两个漂亮的课题也就够了。
对生物人来讲，这个学科的特点是门槛高，但迈过门槛，找课题做文章没那么难，甚至可以说到处都是处女地。生物人的优势是对生物医学生物过程的机理比较熟悉，如果能够掌握一些在数理计算机专业看来很粗浅的数学和计算机知识就可以做一些小课题了。比如我一两年前做了一个预测药物能不能通过血脑屏障的文章，实际上并没有用到多高深的机器学习知识。 对于未知药物或者从来没有用于中枢神经系统的药物，要想让他在中枢见效，首先是要让他穿过血脑屏障，至于有效无效那还是后话，不能透过一切没啥意义。但是要测量药物能不能传统血脑屏障，可不是那么容易，哪怕是动物实验，你也得让针头穿入脑内，测量脑脊液的浓度，这个对实验要求很高。至于在人体上，如果不是对病人绝对必须，根本就不会允许你做，因为医学伦理上过不了关。 基于我的背景，我想，能不能间接观察药物是不是穿透了血脑屏障，有没有什么表征？ 后来我想有啊，嗜睡，昏迷，癫痫发作，乃至精神失常，内分泌失调不都是么。 我把这些药物的副作用信息收集起来进行数据挖掘，只不过用了简单的支持向量机进行区分，发现分类效果相当好，这个结果也发表在了bioinformatics上。
我们生物人入门生物信息难度特别大，但是我们也有很大的优势，我们掌握丰富的生物知识，只要找到趁手的工具，在这些富矿的位置上，不用费太大的劲，也能挖到矿。
评论 (0)