被指藉吸引海外专才，协助窃取科研技术或商业机密的大陆「千人计划」，美方在数个月前已经开始采取行动防范。近日有媒体披露，台湾有33人参加了千人计划。陆委会回应指正密切了解中。台湾有民间组织认为，大陆当局是有系统的全方位渗透。亦有美国学者指出，大陆的行动已经令到西方国家提高警觉。
美国近月来对大陆的「千人计划」加强了排查工作，近日有台湾媒体披露，台湾有33名学者参加了「千人计划」，但由于都是非学校专任现职人员，毋须台湾政府许可。
台湾的陆委会周日（14日）回应时表示，两岸学术交流应符合政府现行相关法令的规定，而有关台湾民众参与千人计划相关情形，陆委会及教育部、科技部等机关，正密切了解中。但就强调，台湾公民不得担任大陆的党政军职务，否则将进行适当处置。
陆委会又指出，大陆推动对台31项措施及相关计划，背后具有政治意图，是陆方整体对台政策的一环，会与各相关部门持续追踪关注后续影响，并健全台湾科研环境及留才、揽才政策，以维护台湾科研优势及产业竞争力。
「台湾联合国协进会世卫宣达团」发言人曾琮恺指出，大陆对台的31项措施是针对学生或企业到大陆就读和发展，还是针对专家学者的「千人计划」，不排除是想透过全方位的形式了解台湾内部的发展。他批评大陆当局的手段层出不穷。
曾琮恺说：大陆是有一个系统的包装，尤其这几年，从孔子学院到现在的千人计划，台湾感受最深的是大陆长期以来的「统战」，包括每年都吸引很多大学生去大陆交流。所以我们看起来就是大陆这些统战的手段是无所不用其极。
中国为引进海外高端人才，2008年底实施「千人计划」，全面引进国家重点产业科技研发人才、团队等。由于获选者能得到100至200万人民币的经费，而且回到中国工作后，更享有更多的福利待遇。对此，引发外界质疑，有关计划是否为了盗取海外先进技术或商业秘密而设。
美国哥伦比亚大学政治学博士王军涛指出，所有的经济、文化、科学等领域都是学术交流，但是涉及到国防安全问题，那么如果台湾没有相关的立法禁止这类交流的话，那么就要自行判断自身的安全形势。
他又说，由于中国近年来在海外的红色渗透情况，已经令到不少西方国家提高警觉，尤其在军事科研上。
王军涛说：其实我觉得下一步最大的问题是，包括美国在内的西方民主国家，当与中国对抗的时候，可能自由民主的一边都会对中国的军事技术的发展比较敏感，而且会想办法防止自己在中间扮演的积极、建设性的角色。
综合外媒报道，美国众议院今年5月通过一项国防授权法案中，就特意注明参加「千人计划」的中国学者，可能无法获得美国国防部的教育培训以及研究经费。随后，美国国务院收紧对留学生的签证期限，特别针对主修「中国制造2025」有关领域学科的中国留学生。
随后的7月和8月，苹果公司前华人员工张晓浪、美国通用电气公司（GE）主任工程师郑小清被指窃取商业机密，并先后被FBI拘捕。其中郑小清就是入选「千人计划」的专家之一。此外，曾经在美国留学和工作的北京大学生命科学学院前院长饶毅，7月申请赴美参加一个学术会议时，签证未获批准。
在9月，大批参与「千人计划」的华裔学者遭美国联邦调查局（FBI）约谈。本月初，一份流出的「千人计划」内部通知显示，为避引起美国进一步的警惕，大陆当局要求联络参与计划的海外学者时不能使用电邮，只能以电话或传真通知到中国参与面试。
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