前总统陈水扁撰文指出，他和民进党总统参选人蔡英文结识在1999年，当时民进党尚未提名他为总统候选人，而蔡教授拨冗为他上了2个小时的WTO相关课程，因此他尊称蔡教授为“国师”应不为过。
在扁办公布的最新“阿扁札记”中，陈水扁指出，蔡英文在2000年民进党取得首度执政权之前，是政治大学专攻国际经贸法的教授，担任政府GATT、WTO谈判的顾问，1999年并出任李登辉总统时代的国安会咨询委员。
陈水扁表示，他和蔡英文的结识是在1999年的学习之旅，那个时候民进党尚未提名他为总统候选人，很感谢蔡教授拨冗为他上了2个小时的课，教的课程就是WTO的相关议题。
陈水扁说，“蔡主席也可以说是我担任总统前的老师，尊称蔡教授为‘国师’应不为过。”
“当我有幸当选为台湾总统，主要负责两岸、外交、国防事务，在筹组全民政府新内阁时”，陈水扁说，“有关陆委会主委的人选，我第一个想到的是蔡英文咨委。”
陈水扁认为，蔡英文的学历及能力是国家的人才，最重要的是她的专业，她对两岸事务的涉猎专研、接触参与，加上国际贸易法律与谈判经验，都是推动两岸经贸关系正常化的有力助手，陆委会主委任内非但站稳台湾主权立场，又能务实前进，是一位极为称职、表现出色的内阁成员。
“2004年我连任成功，蔡主委跟我报告说主委做了四年需要休息，我觉得让她离开内阁团队是国家的损失”，陈水扁透露，如果可以让蔡英文出任驻美代表绝对适才适所，因为陆委会主委与驻美代表都是全方位的工作，陆委会主委干得有声有色，驻美代表也可以胜任愉快。
陈水扁说，他曾指派蔡英文担任驻美代表，他完全可以放心，而蔡英文也一定不辱使命，但可惜蔡英文事亲至孝，碍于父母健康因素，必须随侍左右，不适合远行，因而婉拒
陈水扁表示，2004年10月在不分区立委有一半提名权，女性名额占二分之一，他又想到蔡英文，除了专业形象又是部长级之外，也希望增加她的不同历练，到立法院又是一个舞台，而不分区立委必须是党员，这也是蔡英文与民进党结缘的开始。
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