和中央的关系
十几年前那是又红又专，为两弹一星而建起来的大学（其实是大跃进的产物），众多大头在学校任教，毕业至少可以分配个中科院啥的，于是广受青少年的追捧。64闹了一阵，中央开始戒备，包括借势上台的江前core和胡core。
和教育部的关系
有说法说中科院和教育部为毕业生分配的事经常闹矛盾，于是中科院坚持要自己办一所大学，在各方面的推动下，科大就建立了。由于好长一段时间，中科院的这个儿子风头盖过了教育部的儿子们，教育部甚是恼火，这火一直没降下来。所以老朱在教授大会上做报告，总要提一下和教育部关系进一步加强。
和媒体的关系
天高路远，媒体也懒得造访，除非发生了什么大事，特别是大丑事。唯一和科大关系铁的媒体是中科院的科学时报，经常有科大的报道见诸报端，可惜这个报纸影响力太小。
酒香不怕巷子深，实在是无奈之余的自我安慰。
和全国人民的关系
和媒体的关系走远了，自然和全国人民的关系就走远了。当年全国的高校流行改名，还特爱叫科技大学，我一朋友回家，火车上一老人问，哪个学校的啊。同学答：中国科技大学。老先生一笑，对他的同伴说：瞧瞧，现在的学校越来越会改名了。 呵呵
和全国大学生的关系科大可能得罪的人比较多，所以名声不太好，还经常被人陷害，挨整也是常有的事。有朋友去杭州参加招聘会，某公司派来摆摊的是几个年轻人。朋友递上简历，对方做惊讶装：哎哟，中国科技大学，这个是几流大学啊，怎么从来没听说过。 朋友后来一打听，那位仁兄是杭州某大学刚毕业一年的学生。所以说大家不要瞎吵，吵了是要吃亏的。
和中科院的关系
自己的儿子自己疼，怎奈中科院自己也是问题多多，资金也捉襟见肘。这两年开始重视，派了党组副书记过来兼科大书记，然后又重新弄起所系结合，众多的所长们开始过来当系主任。刚刚实施，希望有点效果。但是有时候发展理念有矛盾。科大要去苏州办研究生院，结果后来西安交大等都办起来了，科大的却没影了，只办了个研究生学院。原因就是中科院要要科大立足合肥，不要到处乱跑分散实力。后来准许在上海又办了一个，前提是不能拉走合肥的一人一马。
和安徽省的关系
表面上和和气气，其实矛盾多多，主要就是个钱的问题，科大不是从安徽得到钱，而是倒贴钱。比如说东区的43亩地就要了科大5000多万，这5000多万说好是给拆迁的百姓的，结果政府黑了一笔，百姓游街堵路很是闹了一段时间。
和自己学生的关系
没得话说，科大学生都是很热爱自己得母校得，有时候可能爱得过了头，于是跑出来和其他学校得学生吵。但是正如校长所说，学生和老师是科大最宝贵得财富。
和合肥市民的关系裤子大的实力他们还是认可的，关系也不错。
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