机师自杀
航空专家韦斯（Mark Weiss）相信「驾驶舱内可能出现搏斗」，或许是一名机师突然崩溃，或有机组人员甚至其他人进入驾驶舱后进行破坏
征 用
征用（commandeering）与一般有政治动机的劫机不同，有国家安全分析员指这情况比较特殊，通常无法第一时间知道歹徒的动机。如2000年一名有精神病纪录的乘客强迫一架载着300人的英航客机坠落，最终被机组人员制服
劫 机
有专家相信马航是遭劫机，政治动机未明。专家对于事件是否一场恐袭有分歧，认为若是恐袭应会有组织在世界关注的此刻出面承认责任，但美国联邦调查局前高层认为，如果恐怖分子背后仍藏有更大阴谋和进一步行动，此刻就有可能仍然按捺着不动声色
机件故障
美国退休机师蒂尔蒙（Jim Tilmon）认为，在极端情况下若然全机「彻底电力故障」也会造成空难，但他承认这情况「极难想像，因为机上多处有很多发电机」，即使引擎推进器全都失灵，仍然有后备推进器足以让客机安全降落
异乎寻常
互联网流传各种异想天开的揣测，包括客机被陨石击中、被某国开火击落、客机降落在偏远小岛，甚至被外星人掳走
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