“十三五”规划纲要提出要统筹政府性基金预算、国有资本经营预算和一般公共预算，是有依据的。现行预算体系由一般公共预算、政府性基金预算、国有资本经营预算和社会保险基金预算四本子预算组成。复式预算适应了不同种类不同性质收支分门别类管理的需要。子预算之间的衔接不可或缺，否则，子预算就成为独立的预算。
中国从1992年开始试编经常性预算和建设性预算，逐步形成了当前由四本子预算构成的预算体系。四本子预算各有定位和覆盖范围，彼此之间相对独立。这样的的预算体系具有中国特色，但仍需进一步优化。加强预算资金间的统筹，突出一般公共预算的主导地位，才能让预算体系更加适应财政作为国家治理的基础和重要支柱的定位要求。
政府性基金预算由各有专门用途的不同性质的基金收支所组成，较好地满足了各种特定事业发展的需要。但是，给各种公共资金加上标记，在一定程度上妨碍了公共资金使用的灵活度。特别是，各种政府性基金收支不一定相等，在以收定支的理财原则下，容易形成资金的沉淀。从性质上看，这些基金收取依靠的是政府权力，与一般公共预算收入中的税收没有太多差别。政府性基金本应该融入一般公共预算。在某些条件一下子难以具备的条件下，政府性基金和一般公共预算之间的统筹力度可适当加大。
国有资本经营预算收入反映的是国有资本分红收益。属于全体国人的国有资本本应更多地用于公共产品和公共服务的提供。这两年，国有资本经营预算资金调入一般公共预算的比例在提高，但这还很不够，国有资本经营预算在国有经济体系内部循环的问题仍未真正解决。进一步提高国有资本经营预算资金统筹比例，国有资本服务全体国人的功能才能更好地发挥。
社会保险基金预算与一般公共预算的联系也应加强。从现实来看，一般公共预算需要拨入资金，充实社会保险基金预算。人口老龄化的加深，导致拨入资金的规模还会进一步扩大。社会保险基金预算不宜与预算体系中的其他子预算直接联系，那样做只会肢解预算。其他子预算和社会保险基金预算的联系，只能通过一般公共预算。惟此，一般公共预算才能确立其在现代财政制度中的地位，促进国家治理的现代化。
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