根据《法院组织法》第63条之1修正草案，特侦组于今日正式吹熄灯号。未来业务会由高检署以下各级检察署，借调相关机关专业人员协助侦查。
今日过后，扁政府于2007年4月2日成立9年多的台特侦组将正式走入历史，曾经让台湾前总统陈水扁因国务机要等案锒铛入狱的特侦组，当初成立目的是为了专责侦办总统、副总统及五院院长、立委等党政高层贪污或重大经济舞弊案。
邱太三说明废除特侦组主张
讽刺的是，特侦组所侦办的第一件大案即是成立它的陈水扁国务机要费案，不但在2008年11月将陈水扁声押禁见，更陆续查出陈水扁涉及龙潭购地、海外洗钱等弊案。之后特侦组亦陆续侦办前总统李登辉涉国安秘帐案、行政院前秘书长林益世及多名高院法官涉贪收贿案。
然而赋予的权力越大必定通向滥权可说是政治上不变的真理，2013年9月特侦组侦办前立法院长王金平疑涉关说案时，前检察总长黄世铭在侦查终结前，夜奔总统官邸向时任总统马英九报告侦查秘密，其行动有如明朝西厂锦衣卫，执掌司法检察大权者却沦为打压政治异己的特务，严重动摇民主社会司法宪政程序，尽管前总长黄世铭最后遭判刑定案，亦引起对特侦组体制的质疑声浪逐渐高涨。
时日立法院提案废特侦组，最后通过《法院组织法》修正案，规定高等法院以下各级法院及其分院检察署检察官执行前项职务时，得经台湾高等法院检察署检察长或检察总长之指定，执行该审级检察官之职权，不受第六十二条限制。拔掉特侦组的设立法源，让特侦组今年底走入历史。
台法务部长邱太三指出，当初成立特侦组是仿效美国特别检察官制度，“但美国的联邦检察官是行政官，不具独立检察权，才需借此取得独立检察权，我国各级检察官均具独立侦查权，资源过度集中且特侦组直属检察总长，无上级机关进行管考”着实有违三权分立精神。
海峡两岸法治落实的真正考验正要开始
此特侦制度在欧洲国家最类似的制度是北欧监察使（Parliamentary Ombudsman），然而监察使职责主要在监督行政与司法机关是否违背“人权保障”之原则，且同时权责仍对国会负责。
除四位国会监察使外亦包括：消费者监察使、公平机会监察使、反族群歧视监察使、反性倾向歧视监察使、儿童监察使、身心障碍办公室监察使、媒体监察使，而非将应隶属司法的涉贪案件权力一把抓不受监督。
现在台湾废除特侦组之后，回复到《刑事诉讼法》基本规定，各地检署的“查缉黑金小组”可公平分摊资源，让所有贪渎案件回归各地检署侦办，回归司法独立精神的初衷虽正确，但综观司法史即便美国开国之初也是筚路蓝缕，美总统杰佛逊尝试介入影响司法权限与大法官马歇尔欲巩固美国司法独立基础之争便是当中翘楚。
如何防止政治力挟民意介入司法独立维护宪政价值、避免“人治”大于“法治”，在中国大陆，中共中纪委书记王岐山领导的京晋浙“监察委员会”，以及废除特侦组后的台湾，海峡两岸法治落实的真正考验都正要开始。
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