台湾教育部长吴茂昆，因为上任至今争议不断，屡受在野党批评质疑、以及民间团体的示威抗议，终于在5月29日当地时间上午时分向台湾行政院长赖清德请辞获准，任期仅有40天，成为台湾政府在1949年以来最短任期的教育部长；在台湾历届行政院部会首长中，亦仅高于在2013年因论文抄袭案而下台的台湾国防部长杨念祖的6天。
吴茂昆在5月29日发表的公开声明中表示：他早在5月25日就已向赖清德口头请辞，原因正是因为自4月19日上任以来，屡遭外界特定的有心人士予以人格上的污蔑与羞辱，最终导致教育部在运作上的困扰，并造成行政院团队的伤害，因此以最高的道德标准要求自己，才有请辞获准的情事。
知名作家龙应台在个人脸书上面为吴茂昆抱不平（图源：VCG）
对于外界评论直指吴茂昆是蔡英文政府为了“拔管”（教育部拒绝让管中闵就任台大校长事件）才指派上任，如今“管已拔矣”，因此吴茂昆也可以“功成身退”；他也在公开声明中为自己连日来受到的质疑做出辩护：他在台大校长遴选事件中完全是“对事不对人”，只是以较高的道德标准去检视大学的领航人候选人而已。吴茂昆并感叹，他长年在研究单位，也担任大学教授与校长，接任教育部长后本要兢兢业业的实现教育理念，却遭到扑天盖地的不实指控与抹黑，造成教育部同仁工作上的负担；因此他希望在他离开后，教育部可以扩大脚步向前迈进。
两岸知名作家龙应台得知消息后，在个人脸书上表示感到“很伤痛”。龙应台认为科学家的培养不易，实在不应该随意拿到政治的舞台上面，导致不断受到折损；更不应该以“打手”之姿上台。龙应台批评主政的民进党政府“可恶”，因为其无法认识到教育的重要性，而“媚俗于民粹、扭曲于选票”。
在“拔管”事件中的挺管方“台大自主联盟”则在脸书上发文：“一个管爷可以抵几个教育部长？”（暗指前任教育部长潘文忠亦因无法处理“拔管案”而下台），并希望赖清德能“还我校长”（即让管中闵就任台大校长）。
至于在台湾政局首度“完全在野”已两年多的国民党，其团书记长李彦秀、副书记长柯志恩、立委赖士葆亦在5月29日下午召开“吴茂昆下台刚好而已！教育部应速发聘管中闵”记者会，表达其党团立场，挺管到底。
吴茂昆虽然请辞，但留下的争议并未就此结束（图源：中央社）
另外，自吴茂昆就任起就对其不抱信任与期待、不断要求他下台的“全国教师工会总联合会”，也在脸书上表示“我们成功了”。全教总拥有八万现役教师会员，是全台最大的教师团体组织；其不但在4月29日公开宣示对吴茂昆采取“三不运动”（不接受吴茂昆主持的会议、不忍受吴茂昆当教育部长、不配合吴茂昆的政策），还曾在5月18日动员现役教师千名前往教育部进行示威抗议。由于全教总的杯葛，教育部为新推行的“12年国民教育课程纲要”而两次召开的课纲审议大会，皆因人数不足而延迟；12年国教新课纲是否能如期上路，将会是下任新教育部长的首个最大难关。
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