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对睡眠论文9个问题的回复

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这是文章《Calcium/calmodulin-dependent protein kinase II α and β differentially regulate mammalian sleep》的第一作者,代表本文所有作者,对Pubpeer上对本文提出的9点评论或质疑做出回应。

在做正式回应之前,我想先说明一下这篇文章的主要内容和发表理由。这篇文章的主要目的是展示一个阴性结果,也就是Camk2b敲除鼠没有NREM睡眠表型。这个结果与日本研究者Ueda, H. R.课题组声称的该基因敲除后NREM下降近2h的结果相悖1,2。我们在Communications Biology发表该结果,希望领域能够认真审视这个基因是否真的参与小鼠基础睡眠调控。

以下是针对这9条评论的具体回应:

一、关于Western blot 灰度值中部分小数尾数重复的问题(#1–3)

评论者注意到Figure 1C、1D 和Figure 2G 的部分Western blot灰度值数值具有相同的小数尾数,并据此认为这些数值“统计上异常”。

这些数值来自图像灰度定量过程,Western blot 定量值受图像灰度、ROI、像素数量、背景扣除以及软件计算和输出精度等因素共同影响。判断这些结果是否可靠,应当回到原始胶图,而不能仅依据数值末位模式进行判断。

回到质疑本身,本文所用的ImageJ灰度值定量方法,的确会产生相同尾数。在视频网站搜索同款定量方法教学视频时,可以看到,视频中按标准流程分析不同膜时,ImageJ 独立导出了多个小数尾数完全一致的灰度值(图1)。

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