日本人学习、接受中医的历史相当久远，然而在近代，日本人开始逐渐抛弃中医，转而光大西医，这其中有什么隐情呢？
中医在日本日渐式微
中在日本曾起到重要作用
受中国影响，古代日本的世界观较为狭隘，是为“三国世界观”，认为世界是由中国、印度、日本三国构成的。“三国世界观”之核心，即“慕夏”世界观——以中国华夏文明为指南针。师从“汉才”是日本大化改新以来的“既定国策”，贯穿日本中世纪。
而1543年葡萄牙人始通日本后，随着西方“拉丁文明”的陆续传入，日本的精英阶层开始敏锐地意识到在三国之外，还有一个文明的西洋世界。这段时间是葡萄牙人在日本活动的高峰期，火枪在这个时候被葡萄牙人传进了日本。火枪后来在日本的战国时代的战争中发挥了重要作用。
日本的医学发展，可以说是有两个明显的段落。第一是汉方医时期。在西医鼻祖荷兰医学传入日本之前，当时中医是东亚的统治性医学。日本与中国一样，没有解剖学，传统中医观念认为，解剖人体是行“非君子之道”。但是中医保守的疗法并不能解除许多患者的痛苦。
第二是西洋方医时期。《解体新书》的出现，是西医荷兰医学的解剖学为患者打开的一扇“天窗”，这扇窗户令日本一些青年医生产生极大兴趣，他们开始鼓动医学馆成立，努力减少中医学部分，更多引入西医学。
日本的中医与西医之争，经历了漫长的大半个世纪。虽然一开始中医占得上风，但最后竞争的结果，是“西学东渐”，西风压倒了东风。
西医如何逆袭中医？
明治维新前后，西方医学成为时代潮流，而汉方医学在日本的命运则急转直下，一度跌入千年未有之窘境。战争是检验技术的试金石。西医逆袭中医，在日本获得压倒性的优势并最终取代中医，也是拜战争所赐。
1867年江户无血开城，末代将军德川庆喜把大政奉还天皇，但不愿归顺的东北诸藩掀起了对抗新政府的“戊辰战争”。战事非常惨烈，与传统冷兵器时代的打打杀杀不同，彼时作战双方已普遍使用杀伤力极大的枪、炮等现代兵器，造成的伤亡很大，特别是由于枪创导致大量出血、感染破伤风的死亡率极高。对此，随军的汉方医生却束手无策。政府军首脑西乡隆盛从英国使馆招聘西医随军出征，挽救了大量伤员，不但大大降低了战事伤亡率，轻伤者还能很快复原重新成为战力。西医在外科手术与临床诊疗的神奇功效，使新政府军政高层深受震动，内战结束后，引进学习西方军医制度和改革传统医疗体制成了明治政府一大急务。
1868年12月，根据天皇的旨意，明治政府将国民的健康和卫生防疫提到国家战略层面加以督导，出台《太政官布告》，宣布全面改革医疗制度，规定今后在日本行医，必须通过国家医学考核才能获得执照。针对当时汉方医生占绝多数，西医人才稀缺的情况，明治政府采用请进来和走出去的方式，积极培养本土西医人才。十年之后，全国通过考核获得西医执照的达到1800多人。虽没有政府明确禁止中医，但封杀其生存空间的政策导向使得中医自行式微：开业医师资格考试科目全是西医内容；汉方药馆被废止，禁止汉方自由买卖，严格控制“处方权”，有西医执照业者才能开中药。
而且，经由江户时代兰学家，德国医学传入日本，加之德国对日本成功向近代化国家转型有启蒙之功，德国医学体制成了明治政府医疗改革的范本。
明治元年，佐贺藩长崎兰医出身的相良安知被任命为 “医学校兼医院”（东京大学前身）大学权大丞，主管政府医疗事业。在佐贺同乡明治重臣大偎重信和副岛种臣支持下，日本全面引入德国医学体制，聘用德国医师，并派遣大量青年才俊到德国学医。明治政府的“医改”不久就大见成效，到十九世纪末，日本本土西医人才大量涌现，医学技术迅速赶上欧美水平，反过来成了中国的学习对象。
一度造福东亚，乃至为人类健康事业做出过贡献的中医却成了落后、保守、愚昧的代名词，甚至很长一段时间被当作“伪科学”遭到无情抛弃，而西医则代表着先进、文明，成为近代日本知识界的普遍共识。
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